ومن خلال سيطرته على الشرطة والسلطة التشريعية والمحاكم وغيرها من أدوات السلطة، قام بقمع الجماعات المناهضة للفصل العنصري بسياسات قال منتقدوه إنها تشبه إلى حد كبير تلك التي انتهجتها بريتوريا: الأمر بالاعتقالات، وتعطيل الاحتجاجات، وتوزيع المحسوبية، وحرمان المنشقين من الوظائف. فر العديد من المثقفين والناشطين السود من كوازولو، وهي مجموعة من 40 موطنًا قبليًا منتشرة في جميع أنحاء مقاطعة ناتال السابقة في الجزء الجنوبي الشرقي من جنوب إفريقيا. (بعد الفصل العنصري، أصبحت كوازولو مقاطعة كوازولو ناتال).
علاوة على ذلك، يقول المؤرخون، إن السيد بوثيليزي كان يسيطر على مقاتلي إنكاثا شبه العسكريين الذين أودت اشتباكاتهم الضروس مع مقاتلي المؤتمر الوطني الأفريقي بحياة ما يصل إلى 20 ألف شخص في أواخر الثمانينيات والتسعينيات. وإلى جانب تمويل حكومة كوازولو، اعترفت بريتوريا في عام 1991 بأنها قدمت دعمًا سريًا لإنكاثا في حربها مع حزب المؤتمر الوطني الأفريقي، مما عزز الادعاءات بأن السيد بوثيليزي تعاون مع الحكومة البيضاء.
وقال مايكل كلوف في مراجعة نشرتها صحيفة نيويورك تايمز لتصريحات السيد بوثيليزي: “اعتماداً على من تتحدث إليه في جنوب أفريقيا، فهو أداة للفصل العنصري، أو معارض شجاع للهيمنة البيضاء، أو أمير حرب قبلي، أو مناصر صاحب رؤية للرأسمالية الديمقراطية”. في كتابه “جنوب أفريقيا: رؤيتي للمستقبل” (1990)، أضاف: “بينما يتحدث ببلاغة عن الحاجة إلى اللاعنف، فقد اتُهم أتباعه بقتل المئات من معارضيهم في مقاطعة ناتال”.
وفي عام 1990، عندما أبدت جنوب أفريقيا استعدادها لحل نظام الفصل العنصري من خلال إطلاق سراح السيد مانديلا ورفع الحظر الذي دام 30 عاما على حزب المؤتمر الوطني الأفريقي، أصبح السيد دي كليرك والسيد مانديلا المفاوضين الرئيسيين لوضع دستور جديد. لكن السيد بوتليزي سرعان ما أدخل نفسه في المفاوضات باعتباره صوتا للرأسمالية، والتعليم، والحقوق القبلية والعرقية، وسلطات للحكومات الإقليمية.
وعلى مدى السنوات القليلة التالية، ومع احتدام المناقشات على الطاولة وتفاقم القتال بين الفصائل، كان السيد بوثيليزي يقاطع المحادثات في كثير من الأحيان. لكن الفصل العنصري انتهى في المستشفيات والمسارح وحمامات السباحة والحدائق العامة والمكتبات ووسائل النقل العام. وظهر دستور جديد، مما أدى إلى إنشاء ديمقراطية برلمانية ذات فروع تنفيذية وتشريعية وقضائية، وشرعة للحقوق، وامتياز عالمي و10 حكومات إقليمية.
